
Stargate Atlantis
L'expédition, en partance vers la galaxie de Pégase et dirigée par le docteur Weir, s'installe dans la cité des Anciens. Elle se voit toutefois rapidement contrainte, pour des raisons techniques menaçant la cité et la vie du personnel, de l'abandonner pour partir à la recherche d'une nouvelle planète. Un groupe d'hommes fait la rencontre de nouveaux alliés, les Athosiens. Malheureusement pour l'expédition, ils vont aussi découvrir un nouvel ennemi : les Wraiths, alors que les explorateurs terriens essaient de sauver certains d'entre eux. Après le réveil de ces nouveaux ennemis dans la galaxie et l'emménagement dans la cité, le docteur Weir et le Major Sheppard ont fort à faire pour repousser les Wraiths, mais aussi les Géniis et d'autres menaces rendant difficiles l'exploration de la galaxie. La vie sur Atlantis n'est pas aussi idyllique que tous l'espéraient et les combats sont difficiles et douloureux pour protéger la ville des Anciens qui finit quand même par être assiégée à la fin de la saison.
- Episodes 21
- Date de diffusion jeudi 12 février
21 épisodes

Episode 1 : Une nouvelle ère (1)
Le SGC envoie une nouvelle équipe dans la galaxie de Pégase, à la recherche de la cité perdue d'Atlantis. Les explorateurs traversent la porte du SGC et se retrouvent immédiatement dans la cité qui reprend vie lentement. Le groupe ne tarde pas à se rendre compte que la cité git tout au fond de l'océan et que les E2PZ sont presque vides, fragilisant le bouclier de la cité qui menace de disparaitre. Le Docteur Weir et son équipe doivent alors penser à quitter les lieux pendant que le major Sheppard fait connaissance avec de nouveaux amis et des ennemis terrifiants : les Wraiths.

Episode 1 : Une nouvelle ère (1)
Le SGC envoie une nouvelle équipe dans la galaxie de Pégase, à la recherche de la cité perdue d'Atlantis. Les explorateurs traversent la porte du SGC et se retrouvent immédiatement dans la cité qui reprend vie lentement. Le groupe ne tarde pas à se rendre compte que la cité git tout au fond de l'océan et que les E2PZ sont presque vides, fragilisant le bouclier de la cité qui menace de disparaitre. Le Docteur Weir et son équipe doivent alors penser à quitter les lieux pendant que le major Sheppard fait connaissance avec de nouveaux amis et des ennemis terrifiants : les Wraiths.

Episode 2 : Une nouvelle ère (2)
Alors que la cité est remontée à la surface au moment où le bouclier a cédé, Sheppard demande l'autorisation à Élisabeth Weir pour porter secours aux habitants du village et aux autres membres de l'expédition enlevés par les Wraiths. Sheppard, Ford et d'autres soldats se rendent sur une planète pour leur porter secours et entrent en confrontation avec leurs ennemis. Sheppard libère les prisonniers mais il doit abréger les souffrances du colonel Sumner car la reine des Wraiths aspire son énergie vitale. Pensant éliminer les créatures, Sheppard tue la reine, ce qui provoque le réveil de tous les Wraiths en hibernation.

Episode 3 : Invulnérable
Peu à peu, l'expédition installe son matériel et ses effectifs au sein de la mythique cité d'Atlantis. Alors que le docteur Rodney McKay se porte volontaire pour mener à bien une expérience de thérapie génique aux conséquences encore incertaines, il actionne par mégarde une étrange pierre ancestrale qui, une fois déclenchée, sert apparemment de bouclier individuel. McKay semble subitement être devenu invulnérable. Cependant, une intrusion extraterrestre passant d'abord complètement inaperçue menace directement la base. C'est alors que l'on constate la disparition d'un enfant athosien, qui jouait avec ses camarades...

Episode 4 : 38 minutes
En voulant échapper aux Wraith et à une créature parasite, le major John Sheppard tente une manoeuvre désespérée en passant la Porte des étoiles avec sa navette. L'appareil reste malheureusement prisonnier du vortex. Selon les connaissances dont disposent les scientifiques, il est impératif de dégager l'équipage avant 38 minutes. Sinon, la porte se refermera automatiquement, entraînant la destruction de la navette. Depuis Atlantis, le docteur Weir tente de mettre sur pied un plan de sauvetage. Il est d'autant plus urgent d'intervenir que le parasite s'est fixé sur le cou de Sheppard et le vide de son énergie vitale...

Episode 5 : Soupçons
Après avoir subi une nouvelle attaque des Wraith au cours d'une expédition sur une planète encore inconnue, l'équipe terrienne soupçonne la présence d'un traître dans ses rangs. Les voyages sont aussitôt suspendus. Les premiers suspectés sont les Athosiens, que le docteur Weir convoque un à un pour les soumettre à un interrogatoire. Teyla apparaît comme la principale suspecte. Pendant ce temps, McKay et Zelenka ouvrent le toit d'Atlantis, permettant ainsi au major Sheppard de procéder à une reconnaissance de la planète. Il découvre un nouveau continent sur lequel les Athosiens peuvent s'installer...

Episode 6 : La Fin de l’innocence
Alors qu'ils explorent une planète inconnue, Sheppard, Teyla, Rodney et Ford détectent un important champ magnétique. S'approchant trop près, leur appareil est déstabilisé et s'écrase. Les naufragés finissent par découvrir d'anciennes ruines, dans lesquelles vit une tribu peu avancée. Ses membres sont persuadés que les Wraiths les épargneront tant qu'aucun de leurs membres ne dépassera l'âge de 24 ans. C'est pourquoi ils se suicident rituellement avant d'atteindre l'âge limite. L'équipe de Stargate tente de localiser l'émetteur responsable du champ magnétique tout en fraternisant avec cette étrange tribu...

Episode 7 : Sérum
L'équipe se rend dans le monde des Ophants, un peuple humain possédant de grandes connaissances médicales qui a entrepris la réalisation d'un vaccin qui pourrait rendre insensible à l'absorption vitale des Wraith. Le major Sheppard propose alors l'aide du docteur Beckett dans l'élaboration du vaccin. Rapidement, ils parviennent à un résultat efficace lors des tests en laboratoire. Cependant, les Ophants exigent de tester le sérum sur le Wraith retenu prisonnier à Atlantis...

Episode 8 : Apparences
Manquant de nourriture, l'équipe veut en acheter aux Jed-nyts, un peuple de simples fermiers, semble-t-il. Mais en contrepartie, ceux-ci réclament du C4. Sheppard et McKay découvrent que les braves cultivateurs préparent en secret une arme mortelle pour attaquer les Wraith...

Episode 9 : Retour sur Terre
Une expédition est menée sur une planète de la constellation Pégase. Rodney estime que cette planète possède probablement une énergie suffisante pour créer un vortex vers la Terre. Une équipe se rend sur les lieux pour tenter l'expérience. Le docteur Weir fait partie de l'expédition, qui s'avère un succès. Les membres de l'équipe parviennent à contacter le SGC et retrouvent la Terre. Cependant, ils ont bientôt le sentiment que tout n'est pas réel. Sont-ils tombés dans un piège ? Evoluent-ils à présent dans un univers parallèle ?...

Episode 10 : En pleine tempête (1)
Une énorme tempête menace la cité et les Athosiens. Alors que Weir et Sheppard préparent l'évacuation, les Genii profitent de la situation pour envahir Atlantis.

Episode 11 : En pleine tempête (2)
La tempête redouble d'intensité, et un raz de marrée menace la cité. McKay tente alors d'utiliser la foudre pour alimenter le bouclier de protection et éviter sa destruction.

Episode 12 : Duel
Sheppard et son équipe, McKay, Abrams et Gaul, découvrent et explorent un vaisseau Wraith abandonné, datant de la bataille des Anciens. Ils captent un faible signal de détresse en provenance d'une planète proche, sur laquelle ils se posent. Sur place, ils découvrent un vaisseau de ravitaillement Wraith, entouré de cadavres...

Episode 13 : Virus
Durant une inspection de routine sur Atlantis, un groupe sous le commandement du docteur McKay lance une alerte. En effet, plusieurs membres de l'expédition sont morts d'une rupture d'anévrisme générée par des hallucinations. Mais ces décès ne paraissent pas naturels au docteur, et l'ordre est donné de mettre Atlantis en quarantaine. Isolée, l'équipe de chercheurs de McKay découvre un laboratoire en virologie des Anciens totalement dévasté. Défiant l'autorité du docteur Weir, Sheppard et Teyla partent à la poursuite d'un membre du groupe qui s'est échappé...

Episode 14 : Hors d’atteinte
Au cours d'un vol d'exploration, l'équipe de Sheppard, assaillie par des tirs-surprises émanant de chasseurs Wraith, est sauvée de justesse par un mystérieux champ énergétique. L'équipe suit le phénomène jusqu'à une planète inconnue, Proculis, sur laquelle elle atterrit. Sur cette zone fertile, Sheppard, Teyla, McKay et Ford découvrent un monde proche de celui des humains, étrangement resté à l'écart des attaques meurtrières des Wraith...

Episode 15 : Le Grand Sommeil
Lors de l'inspection d'Atlantis, Sheppard, Ford et Teyla découvrent le corps d'une femme, en état de stase depuis 10 000 ans. A son réveil, ils apprennent, stupéfaits, qu'il s'agit du docteur Weir. Après le premier débarquement, qui avait échoué, et l'évacuation forcée d'Atlantis, Weir s'était retrouvée à bord d'une machine à voyager dans le temps. Elle s'était ensuite réveillée cent siècles plus tôt dans la même cité occupée par les Atlantes, où elle avait rencontré le conseil des Anciens...

Episode 16 : La Communauté des quinze
En parcourant les archives de Dagan, l'équipe découvre qu'un E2PZ fût confié à une communauté. Décidés à le retrouver, ils se lancent dans cette quête. Mais rapidement Kolya va les rejoindre.

Episode 17 : Derniers messages
Les Wraith doivent accoster sur Atlantis dans moins de deux semaines. Il n'y a plus d'espoir, sauf à tenter de récupérer un E2PZ sur la planète M7G677, située sur le parcours de la flotte ennemie. Cette arme est la seule qui puisse encore sauver Atlantis et l'Humanité. Sheppard part en mission accompagné de Teyla, qui connaît le chef des habitants, Orin, qu'elle espère sauver avant l'attaque des Wraith. Pendant ce temps, sur la base, Weir a intimé l'ordre aux membres de l'équipage de produire des messages vidéo d'adieux destinés à leurs proches, qui suivront le message officiel de détresse destiné au SGC sur Terre...

Episode 18 : Sous hypnose
Alors que les nuits sont calmes sur Atlantis, Teyla ne cesse de cauchemarder sur les Wraiths. Sheppard lui conseille de consulter la psy de la station. Toujours angoissée, Teyla se rend sur le continent, accompagnée de Carson, pour consulter sa grand-mère. Celle-ci lui révèle le terrible secret de sa lignée : elle fait partie de ceux qui ont été victimes d'expériences menées par les Wraith sur les azotiens...

Episode 19 : Assiégés (1)
Alors que trois vaisseaux volent vers la cité, McKay parvient à activer le satellite de défense. Pendant ce temps, Zelenka prépare l'autodestruction de la cité, et le major découvre un espion.

Episode 20 : Assiégés (2)
Les Wraiths commencent l'attaque d'Atlantis, et l'équipe craint le pire, quand le Dédale arrive à la rescousse. Mais les Wraith détruisent les ogives nucléaires -les renforts semblent destinés à échouer dans leur mission !